Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG13O75143 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG13O75143 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG13O75143 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms