Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPAG9O60271 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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