Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT7O43581 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT7O43581 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT7O43581 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT7O43581 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYT7O43581 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms