Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COCHO43405 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COCHO43405 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COCHO43405 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COCHO43405 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms