Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SIAH2O43255 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms