Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR1CO15160 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms