Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APAF1O14727 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APAF1O14727 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APAF1O14727 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
APAF1O14727 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms