Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
O00370 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
O00370 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
O00370 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
O00370 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
O00370 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
O00370 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms