Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DFFAO00273 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DFFAO00273 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DFFAO00273 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms