Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HMGB1P1B2RPK0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms