Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A8MVJ9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A8MVJ9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms