Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD8B2A6NJW9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms