Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMX3A6NHT5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms