Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC162PA2VCL2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC162PA2VCL2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms