Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC144AA2RUR9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms