Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAP3K4Q9Y6R4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms