Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP3Q9Y6F1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PARP3Q9Y6F1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms