Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAB39Q9Y376 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms