Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
THRAP3Q9Y2W1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THRAP3Q9Y2W1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms