Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
POLR1DQ9Y2S0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms