Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNQ9UQP3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms