Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHANK2Q9UPX8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms