Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EDARQ9UNE0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EDARQ9UNE0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms