Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms