Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MLH3Q9UHC1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH3Q9UHC1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms