Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT172Q9UG01 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms