Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VTI1BQ9UEU0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms