Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPAR3Q9UBY5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms