Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS29Q9UBQ0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms