Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC180Q9P1Z9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC180Q9P1Z9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms