Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HACD3Q9P035 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HACD3Q9P035 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms