Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREM2Q9NZC2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREM2Q9NZC2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms