Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms