Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms