Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms