Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMSN1Q9NSI8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms