Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms