Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms