Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZC3H12CQ9C0D7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms