Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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FOXQ1Q9C009 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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FOXQ1Q9C009 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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FOXQ1Q9C009 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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FOXQ1Q9C009 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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FOXQ1Q9C009 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXQ1Q9C009 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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