Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP1Q9C000 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP1Q9C000 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms