Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIM55Q9BYV6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms