Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSDMCQ9BYG8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms