Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PACSIN1Q9BY11 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PACSIN1Q9BY11 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms