Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VN1R3Q9BXE9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R3Q9BXE9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms