Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SMIM2Q9BVW6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms