Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTDSS2Q9BVG9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms