Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KATNB1Q9BVA0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms