Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf16Q9BUW7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms