Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
LIMD2Q9BT23 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LIMD2Q9BT23 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LIMD2Q9BT23 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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